مديريت عامل طبق چارت سازماني در بالاترين بخش اجرائي قرار دارد . مصوبات جلسات هيئت مديره براي اجرا به مدير عامل ارسال مي گردد و مديريت عامل آنها را با روش نيكو عملياتي مي سازد.
انتظام امور موسسه ، بخشها ، كارمندان و نظارت بر تمام برنامه هاي اجرائي در ارتباط با ساير سازمانهاي ذيربط و حضور در مجالس و سمينارها و تشكل هاي امور خيريه از شرح وظايف مديرعامل محترم مي باشد.
انتخاب مدير عامل با دقت نظر و شور و مشورت از بين افراد متخصص ، شايق و علاقه مند به امور خيريه ، مدير و مدبر ، مجرب ، خوش نام و متدين انتخاب مي شود. و تا زمانيكه مديريت مدبرانه دارد در راس امور خواهد بود.